利用LC-MS/MS技术对单一纯化蛋白样品或单一胶条(SDS-PAGE)、IP、Co-IP溶液等样本进行蛋白鉴定。
一、实验原理
对于混合物样本,先进行SDS-PAGE分离(或IP、Co-IP、Pull-down),然后对分离后的样本或单一纯化样本进行酶解,之后通过质谱进行测定,肽段在质谱仪中离子化后,会带上一定量的电荷,通过检测器分析,可得到各肽段的质荷比(m/z),为获得肽段的序列信息,质谱仪会对肽段进行破碎,再次分析,获得二级质谱,检索软件根据二级质谱信息与相应的数据库比对,结合匹配度打分及错配过滤,可得到肽段的确切序列,进而拼接出各蛋白的完整序列,从而实现对蛋白的鉴定。
二、实验流程
三、送样要求
1. SDS-PAGE条带,考染、银染(质谱兼容)条带清晰可见。
2. 蛋白质溶液(针对IP、Co-IP纯化获得的蛋白液),蛋白质总量>10μg,浓度>0.5μg/μL,缓冲液不含去污剂NP40、Triton X-100等。
3. 液体建议低温,冰袋送样。
四、结果交付
原始数据及实验报告。